Nová studie schizofrenie se zaměřuje na interakce protein-protein

Podobně jako u lidí lze o genu toho hodně zjistit, když se podíváme na společnost, kterou udržuje, a sledujeme, jak se chová. Ve snaze odhalit více vodítek o vývoji schizofrenie vědci na Lékařské fakultě University of Pittsburgh prozkoumali, jak proteiny produkované geny souvisejícími se schizofrenií vzájemně interagují.

"Můžeme odvodit, co by protein mohl dělat, tím, že zkontrolujeme společnost, kterou udržuje," řekl vedoucí vyšetřovatel Madhavi Ganapathiraju, Ph.D., odborný asistent biomedicínské informatiky, Pittova lékařská fakulta.

"Pokud například vím, že máš mnoho přátel, kteří hrají hokej, mohlo by to znamenat, že se také věnuješ hokeji." Podobně, pokud vidíme, že neznámý protein interaguje například s více proteiny zapojenými do nervové signalizace, existuje vysoká pravděpodobnost, že se stejného podílí i neznámá entita. “

V nedávné historii vědci provedli mnoho asociačních studií na celém genomu (GWAS), které úspěšně identifikovaly genové varianty spojené se zvýšeným rizikem schizofrenie. Podle vědců je však relativně málo známo o bílkovinách, které tyto geny vytvářejí, o tom, co dělají a jak interagují.

"Studie GWAS a další výzkumné snahy nám ukázaly, jaké geny mohou být relevantní pro schizofrenii," řekl Ganapathiraju. "To, co jsme udělali, je další krok." Snažíme se pochopit, jak tyto geny navzájem souvisejí, což by nám mohlo ukázat biologické cesty, které jsou při nemoci důležité. “

Stručně řečeno, každý gen vytváří proteiny a tyto proteiny obvykle interagují v biologickém procesu. Studium toho, jak se tyto proteiny chovají navzájem, může osvětlit úlohu genu, který dosud nebyl studován, a odhalit cesty a biologické procesy spojené se schizofrenií i její vztah k dalším komplexním chorobám.

Po vývoji a použití nového výpočetního modelu s názvem High-Precision Protein Interaction Prediction (HiPPIP) vědci objevili více než 500 nových interakcí protein-protein (PPI) spojených s geny spojenými se schizofrenií.

Vědci dodávají, že zatímco geny spojené se schizofrenií identifikované historicky a prostřednictvím GWAS se málo překrývaly, model ukázal, že sdíleli více než 100 běžných interagujících látek. Zjištění by mohla vést k lepšímu pochopení biologických základů této duševní nemoci a také k nasměrování léčby.

Zjištění jsou zveřejněna online v npj schizofrenie, časopis Nature Publishing Group.

Zdroj: Školy zdravotnických věd University of Pittsburgh