Počítačová hra Phylo podporuje výzkum v oblasti zdraví

Inovativní výzkum využívající webovou videohru spojuje lidi s počítači za účelem zlepšení vědeckých poznatků o genetických základech nemocí, jako je Alzheimerova choroba, cukrovka a rakovina.

Tato hra s názvem Phylo byla vyvinuta počítačovým vědcem Dr. Jérôme Waldispuhl z McGill University a spolupracovníkem Mathieu Blanchette v roce 2010.

Phylo je navrženo tak, aby příležitostným hráčům umožnilo přispívat k vědeckému výzkumu uspořádáním několika sekvencí barevných bloků, které představují lidskou DNA. Při pohledu na podobnosti a rozdíly mezi těmito sekvencemi DNA mohou vědci získat nový vhled do různých geneticky podmíněných chorob.

Za poslední rok si 17 000 registrovaných uživatelů Phylo mohlo hru jednoduše zahrát pro zábavu nebo se rozhodnout pomoci s dekódováním konkrétní genetické nemoci.

"Mnoho lidí uvedlo, že si užili hraní hry, která by mohla pomoci vysledovat původ konkrétní nemoci, jako je epilepsie," řekl Waldispuhl.

"V myšlence hrát hru a současně přispívat k vědě je spousta vzrušení," souhlasila Blanchette. „Je to hraní bez viny; nyní si můžete říci, že to není jen promarněný čas. “

Waldispuhl a jeho studenti přišli s nápadem použít videohru k vyřešení problému zarovnání více sekvencí DNA, protože je to pro počítače obtížný úkol.

"Existují určité výpočty, které lidský mozek provádí efektivněji než kterýkoli jiný počítač." Rozpoznávání a třídění vizuálních vzorů spadá do této kategorie, “vysvětlil Waldispuhl.

"Počítače jsou nejlepší v manipulaci s velkým množstvím špinavých dat, ale tam, kde požadujeme vysokou přesnost, potřebujeme lidi." V tomto případě byly genomy, které analyzujeme, již předem zarovnány počítači, ale existují jeho části, které nejsou správně zarovnány. Naším cílem je identifikovat tyto části a transformovat úkol jejich sladění do hádanky, kterou lidé budou chtít vyřešit. “

Od spuštění hry v listopadu 2010 vědci obdrželi více než 350 000 řešení problémů se sekvencí zarovnání.

"Phylo přispělo ke zlepšení našeho chápání regulace 521 genů podílejících se na různých onemocněních." Potvrzuje také, že obtížné výpočetní problémy lze zakomponovat do neformální hry, kterou mohou snadno hrát lidé bez jakéhokoli vědeckého vzdělání, “uvedl Waldispuhl.

"To, co zde děláme, se liší od přístupů klasické občanské vědy." Nenahrazujeme lidi počítači, ani je nežádáme, aby soutěžili se stroji. Pracují společně. Je to synergie lidí a strojů, která pomáhá vyřešit jeden z nejzásadnějších biologických problémů. “

Zdroj: McGill University