Technologie videohier podporuje výzkum rakoviny

Novým trendem ve vědeckém výzkumu je použití technologie videohry k simulaci lidské tkáně.

Vědci z Wake Forest University používají k simulaci vnitřního fungování lidských buněk grafické jednotky (GPU), technologii, která činí videohry tak realistickými.

Dr. Samuel Cho, biofyzik a počítačový vědec, uvedl, že popularita videoher byla také darem z nebes, protože pomohla snížit cenu GPU, aby je nyní bylo možné použít pro výzkum.

Kromě toho tato technologie nyní umožňuje Cho přesně vidět, jak buňky žijí, dělí se a umírají. A to podle něj otevírá možnosti pro nové cíle pro léky zabíjející nádory.

Choova nejnovější počítačová simulace kritické molekuly RNA, která je součástí lidského enzymu telomerázy, osvětluje dříve neznámé skryté stavy při skládání a rozkládání této molekuly.

Výsledky jeho výzkumu se objevují v Journal of the American Chemical Society.

Lidský enzym telomerázy se nachází pouze v rakovinných buňkách. Přidává drobné molekuly zvané telomery na konce řetězců DNA, když se buňky dělí - což v podstatě brání buňkám v umírání.

"Buňka se stále reprodukuje, a to je samotná definice rakoviny," řekla Cho. "Tím, že víme, jak se telomeráza skládá a funguje, poskytujeme novou oblast pro výzkum léčby rakoviny."

Vizuální reprezentace poskytuje vědcům mnohem přesnější pohled na fungování molekuly. To zase může umožnit vývoj nových léků, které mohou blokovat působení enzymu a potenciálně zastavit růst rakovinných buněk.

Konkrétně by nový lék zastavil přidání lidského enzymu telomerázy na DNA, takže by nádorová buňka zemřela.

Cho v současné době zkoumá využití technologie videohry ke zkoumání bakteriálního ribozomu - molekulárního systému 200krát většího než molekula lidského enzymu telomerázy RNA.

Jeho výzkumná skupina začala k provádění těchto simulací buněk používat grafické karty zvané GPU, což je mnohem rychlejší než při použití standardních výpočtů.

"Tuto technologii jsme unesli, abychom provedli simulace velmi, velmi rychle na mnohem větších biomolekulárních systémech," řekl Cho.

Bez GPU odhadoval Cho, že by mu simulace trvalo více než 40 let. Je překvapivé, že použití této technologie umožní, aby byl výzkum proveden za pouhých několik měsíců.

Zdroj: Wake Forest University